机械过滤器的运行操作包括反洗、正洗和运行三个步骤。

1、反洗   反洗时，先关闭出、入口阀门，保持滤层上部水位200-300mm。开启反洗排水阀门，开启压缩空气，向过滤器内送入强度为18-25L/（s.m2）的压缩空气，吹洗3-5分钟。压缩空气不停，开启反洗入口阀门，以反洗排水中无正常颗粒的滤料为限，控制反洗水流量。在反洗过程中，应经常检查反洗排水中有无正常颗粒的滤砂，以防滤料跑失。待反洗排水后，停止压缩空气的吹洗，继续用水反洗3-5分钟。

2、正洗   正洗时开启正洗排水阀门出、入口水阀门，维持正流水流速10-15m/h。冲洗至出水清净后，即可投入运行。正洗时，出水应无滤料，否则可能是因为反洗操作不当而造成过滤器下部配水装置损坏。此时应停止正洗、查明原因并处理好后，再恢复正洗。

3、运行   运行流速为10-12m/h。运行周期的控制以其水头损失达到容许极限（规定一般应小于0.05MPa）或按一定运行时间来进行反洗。